自1646年九月八日開始，完成了階段休整并等到了后方運上來的糧秣的孫傳庭、黃蜚兩部再次以水陸并進的方式向萬縣發(fā)起了進攻，袁宗第、辛思忠兩部雖然節(jié)節(jié)抵抗，但卻根本擋住不孫、黃兩軍的進攻，最終于當年九月二十六日這一天，丟掉了萬縣。

在孫傳庭和黃蜚兩部奪取萬縣的前一天，在達州等地擁明士紳、地主武裝的引領下，作為偏師的明軍馬得功部在奪取了豆山關后，開進了新寧（開江）縣城；受到馬得功部進駐開江的鼓舞，達州士紳驅逐了城內的小股順軍，宣布與東鄉(xiāng)（宣漢）一起重新歸入大明的治下。