比預(yù)想的時間略微晚了一點后，最后一批運載濟州城百姓的淮乙船在崇禎八年三月初二下午申末時分離開了濟州港，駛向了小琉球。

根據(jù)運輸計劃，不管原先地位高低、財富多寡，全部7300多濟州城內(nèi)百姓中的3300人將被運往蝦夷地和苦兀島南部安置點，另外4000名濟州百姓將被運往小琉球安置；此后，前往蝦夷地和苦兀島的淮甲船隊會徑直返回云梯關(guān)，以便運輸河南百姓來濟州島安置和過渡；而前往小琉球的船隊中，有一半會運載小琉球王莊提供的糧食，返回云梯關(guān)和濟州島，然后再分別運輸河南百姓和濟州島的朝鮮百姓南下小琉球，另一半則會前往福建采購，并稍后南下安南和占城，采購糧米、柚木，再運回濟州島，實施第二輪次的運輸。