既然北鎮(zhèn)撫司對外，那么南鎮(zhèn)撫司很自然的就是對內，南鎮(zhèn)撫司不僅分管整個錦衣衛(wèi)的軍紀法紀，還負責對重要人物的保衛(wèi)工作，有點像現在的憲兵，所以南鎮(zhèn)撫司雖然只有兩千五百多人，可是人人都是高手，畢竟一旦錦衣衛(wèi)內部的人違反法紀，那是要靠南鎮(zhèn)撫司緝拿歸案的，如果身手不好，怎么打得過自己人。

南鎮(zhèn)撫司經常會挑選一些高手進入內務府，然后由內務府分派到宮內，或者是哪個王爺，妃子，皇親國戚等等的府上進行護衛(wèi)任務。比如說隨著魏忠賢的權利擴大，對手越來越多，魏忠賢也感覺到僅憑東廠和錦衣衛(wèi)原來配給他的百余名護衛(wèi)已經不能滿足他的出行需要，所以他特地找來田爾耕，跟他說了要增加衛(wèi)士，正好南鎮(zhèn)撫司新選入了一批地方上進來的高手，田爾耕就責成南鎮(zhèn)撫司給魏忠賢挑選一批衛(wèi)士補充到司禮監(jiān)。